随着尚可喜大军的溃败，洪承畴完全失去了在荆江上阻截大顺军的能力。
而此时荆州城已经被荆江水包围，陆军无法抵达，洪承畴只能眼睁睁看着李自成率大军救援荆州。
不过，此时的荆州城内已经成了人间炼狱。
城中的瘟疫已经扩散开来，荆州城几十万军民已经有十分之一的人病倒在地。
明朝末年，天灾人祸不断，大顺军中也出现过瘟疫，李过懂得一些基础的防治瘟疫的办法。
不过，此时的荆州城中缺医少药，很难救治患者，只能采用最简易的隔离方法，防止瘟疫进一步传播。
李过在城墙上和城中的房屋内，开辟出了专门放置患病军民的区域。
并且派出士兵把守，外人不得靠近，每日派专人去给这些患病的军民送饭。
同时，李过也下令，对于经常接触病患的士兵，必须要用布遮住口鼻，防止自己也受到感染。
但是，这依然不能完全阻断瘟疫在城中的传播。
依然会有口渴至极的百姓和士兵冒着生命的危险偷喝江水。
另外，每日负责看守和照料病患的士兵也会携带有瘟疫病毒，也在不断将病毒传播给其他健康的军民。
荆州城中，每日都有大量的百姓和士兵死亡。
而这些死亡军民的尸体又十分难以处理，将尸体继续留在城墙或者屋里必然会腐烂，传染更多的人，现在城中又没有土地来掩埋尸体。
李过只能命人将这些人的尸体重新抛回道江水中，这使得城中江水的感染、致病性更强。
就在荆州城到了最危难之时，李自成终于率领大军赶到。
荆江已经改道，江水绕荆州城而过，不过城墙周围吃水深度达几米深的大型战船并无法抵达，李自成只能命大军换乘了小型民船，来到了荆州城下。
此时的荆州城墙上，仍有大顺士兵正在向外了望，期盼着援军的到来。
看到城外有船只过来，并且认出是己方的士兵后，城墙上的守军发出了一阵欢呼。
援军抵达的消息传遍了全城。
然而，站在船头的李自成却发现了城中的异常，守城士兵死气沉沉并无一点活力，并且一些士兵还用破布遮住了口鼻。
他心里暗叫一声不好，连忙向士兵发问，“当前城中情况如何？”
领头的小校听到李自成的询问，带着哭腔回答道：“陛下，城中缺粮少水，而且正在闹瘟疫，死了很多人。”
瘟疫！
李自成最害怕的情况还是发生了！
他知道古代医疗条件太差，防治瘟疫只能靠隔离，根本无法治疗。
只能等感染瘟疫病菌的宿主全部死亡后，瘟疫自行消散。
此时，城门处的几名守兵，一头扎进了浑浊的江水里想要打开城门迎接李自成大军进城。
李自成向着城上大声喝道：“不要打开城门！叫补之将军过来见朕。”
李过已经收到李自成到来的消息，此时已经赶到了城墙边，他朝李自成的方向跪拜道，“臣参见陛下。”
李自成赶忙让他起来，对他说道：“补之，城中瘟疫具体情况如何，你速速告诉朕。”
李过站起身，回复道：“陛下，城中感染瘟疫者十之一二，并且已经死了数千军民。”
李自成闭上眼，长叹了一口气，想要平复一下心情。
他迅速整理了一下思绪，对李过说道：“补之，你们暂时还不能出城，防止将瘟疫传播给其他士兵。”
“你们在城中再等待几日，等朕安排好之后会陆续接你们出城。”
李过拱手道：“臣遵旨。”
他又问李过道：“城中现在缺少什么？朕每日派士兵运送过来。”
李过答道：“陛下，城中现在极其缺水，还缺少粮食，另外做饭的器具和柴火也都缺乏。”
李自成命人将这些记下，转头对李过说道：“补之，你先去安抚城中士兵和百姓的情绪，朕马上派人将城中需要的物资送来。”
李自成的到来让荆州城中军民的心安定了下来，虽然城中瘟疫仍然严重，但是大家都相信，他们马上就会得救。
时间就是生命，李自成率军返回后，立刻命人将大军所携带的军粮、饮用水、药物和做饭的器具运送到了城内。
并且他下令各州府县，征集物资，紧急调往荆江南岸。
李自成要求运送物资的士兵，不要进城，让城上的守军用绳子将筐吊下城来，然后再将筐装满物资的筐拉上城去。
荆州城中，终于解决了吃喝的问题，军民的情绪暂时稳定了下来。
但是李自成一刻不敢耽误，大顺军中除了一些每日向城中运送粮草和其他必备物品的士兵外，李自成将其他士兵全都交给了堵胤锡，命他以最快的速度在荆州城对面的荆江南岸建立一个可以容纳数万人的营地。
大军行动迅速，在周围砍伐树木，很快建造了好了第一批简易的营地，并且准备好了生活所需的一切物资。
按照李自成的吩咐，堵胤锡将营地分成了重症区、轻症区和无症状区三个区域，每块区域相隔一段距离。
随后，他专门挑选了一批士兵，留在营地中，负责照顾营地中的军民。
一部分营地建好之后，李自成立刻行动。
他派出士兵，划着民船，每日去荆州城将城中的军民接到营地之中。
首先接触的是重症人员，营地中派有郎中对他们进行紧急救治。
其次接出来的是轻症人员，营地中的郎中按照患者症状配好了中药，每日让他们服用。
最后接出来的是剩下的无症状人员，堵胤锡命他们留在营地中观察，七天后才能恢复正常活动。
又过了几日，荆江南岸的营地全部建好，城中的百姓和士兵全部被接出了城，安置到了营地中。
就在大顺士兵忙着救援荆州城中的百姓和士兵时。
洪承畴见荆州城已经成为死城，已经无法再进一步取得更大的战果，他便将目光瞄向了别处。