话说朱元璋率领着自己手下的大军离开了益州，前往凉州投靠公孙瓒。
朱元璋率领大军离开后，孙策便顺利的占据了益州。
～叮咚
“恭喜宿主，占领益州，现在宿主共占领三州之地，奖励各项属性+1，随机获得一位已经爆表出来的武将。”
～叮咚
“宿主现基础统率90，武力91，智力90，政治81，魁力88。”
孙策暗道：“想不到我已经成长到如此地步了？”
～叮咚
“恭喜宿主获得杨业统率92，武力97，智力80，政治61，魁力76。杨业植入身份为益州将领，现在宿主军中。”
杨业乃北宋名将，倜傥任侠，善于骑射。忠烈武勇，甚有智谋。北汉建立后，任保卫指挥使，以骁勇闻名远近。宋太宗灭亡北汉后，素闻其名，拜郑州刺史。太平兴国五年，在雁门关大破辽军，威震契丹。算得上是杨家将的建立者。
孙策笑道：“能够得到‘杨无敌’老将军也算不错。”
孙策进入益州前，便命令手下士兵不准骚扰百姓，所以益州百姓对孙策并不算太过反感。
孙策占据益州后，对于朱元璋管理益州的制度，并没有做太大的调整，所以也没有影响到百姓的正常生活。而且孙策还下令免除益州百姓一个月的税收，以此来得到益州百姓的支持。
对于没有离开的益州官员，孙策依旧让其担任原来的职务。对于世家那一边孙策也与其交好，尽量不惹起纷争。因为孙策刚刚占据益州，尚未完全掌控益州，对益州也还不够了解，所以孙策短时间内不想与益州原来的势力相争。
两个月过后，此时孙策已经完全掌控益州了。现在孙策自然需要对益州做些调整，不然不足以震慑益州其他势力。
在益州的制度上孙策，孙策废除了朱元璋的旧制，只保留了几条孙策认为很好的制度。之后采用了历史上诸葛亮、法正、伊籍、刘巴、李严等五人一起研究制造《蜀科》。
《蜀科》是历史上三国时期蜀汉用以约束蜀地军民，治理蜀汉用的法律。刘备在平定益州以后，命诸葛亮、法正、伊籍、刘巴、李严等五人一起研究制造《蜀科》的，《蜀科》自然十分适合益州。
不过孙策还是担心因为蝴蝶效应益州的情况发生改变，《蜀科》不再那么适合益州了。所以特意请刘基、诸葛亮、王猛、荀彧等人将《蜀科》进行改动，改动完之后孙策才实行《蜀科》的。
果然不出孙策所料《蜀科》实行之后蜀中官员的工作效率明显提高，吏治也逐渐清明。而且《蜀科》公正公平，百姓也无怨言。
还有《蜀科》还限制和打击‘专权自恣’的官僚及豪强，帮助孙策打压了益州的官僚、世家、豪强，使得孙策更好地掌控益州。
话说在孙策攻打益州的这段时间里，北边可没太平过。在这段时间里，黄巾军和刘邦打得不可开交。