三十年前，由伍德曼、威斯考特和艾莲主持『精灵术式』仪式，卡莲在远程操作『显现装置』协助，汇集这个世界储存的魔力和灵脉，创造出被称为『精灵』的魔导生命。
这一位『精灵』的诞生，引发了一种前所未有的超大型空间爆炸，在日后被人们称之为『空间震』，这个首次发生的『空间震』造成了一亿五千多万人员伤亡，成为人类史上最惨烈的灾难。
『精灵』是四位魔术师为了向这个世界复仇而创造出来的“武器”，拥有毁天灭地的力量，只不过『精灵』的心智和初生的孩子一样，对一切懵懂无知，在四位魔术师要将她带走之时，她逃了。
『精灵』并不知道，自己并不需要逃跑，那四位魔术师，她的创造者，只是一帮掌握着超凡知识的人类，根本无法对她构成任何威胁，她甚至不费吹灰之力就能将那四人杀死。
漫无目的地四处逃跑，过程中，『精灵』无意识地引发了一次次『空间震』，这使得人类在悲痛的灾难中，认识到这种现象的危害，各国开始想办法应对，空间震预警、地下避难所、对抗精灵部队……在后来慢慢发展成熟。
最后，『精灵』的“逃亡之路”，在降临到某个岛国的城市，与一位名叫『崇宫真士』的高中少年邂逅，画上句号。
真士在爆炸的事发地，发现了一个赤身Luo体的少女，或许是出于恻隐之心，又或许是一见钟情，真士在隐约猜到这名少女不是一般人的情况下，还是将她带回家里。
不出意料的，将一个来历不明且没穿衣服的美少女带回家，真士的妹妹——『崇宫真那』，差点就要大义灭亲、打电话报警了。
真士费劲口舌解释，真那才勉为其难地相信自家哥哥没有堕入犯罪的道路，也接受了暂时留下无名少女的请求。
之后，崇宫兄妹见识到了无名少女的异常之处，刚见面时还只能发出“啊”、“唔”之类的声音，在博览群书，又从电视和收音机接收了各种信息过后，无名少女就掌握了语言体系，能够流利地说出各国语言。
这份恐怖的学习能力不只是体现在语言方面，无论是什么知识和技能，无名少女都能一学就会，样样精通，并且学习掌握的时间极短，根本不是人类能够做到的。
尽管非常震惊，但崇宫兄妹还是继续收留了无名少女，给她取了一个名字『澪』，对外介绍是亲戚，因此全名为『崇宫澪』。
无名的『精灵』，获得了『崇宫澪』之名。
之后，崇宫兄妹与澪度过了一段快乐的时光，一起生活，一起逛街，一起玩耍……甚至，真士鼓起勇气，邀请了澪一起约会，他喜欢澪，澪也在这段时间喜欢上了真士。
幸福的生活让澪忘了自己的身份，忘了有那么一群人，在锲而不舍地追寻自己，于是某一天，『D.E.M.社』——四位魔术师创立的组织，实施大规模的抓捕行动。
真那被『D.E.M.社』作为人质抓了起来，真士在带着澪逃亡的途中，不幸被威斯考特枪杀，真士的死，让澪爆发了，悲愤交加地破坏周围的一切，然后带着真士的遗体离开现场。
真士死了。
澪在崩溃边缘发了疯思考，但即使是她，也无法让人起死回生，她想过殉情，但尝试了各种自杀方式后都失败了，常规的手段根本无法将她杀死，只有与她同根同源的灵力，才能够伤到她。
不知道过了多久，澪突发奇想——如果不能复活真士，那就将真士“制造”出来！
于是，澪吸收了真士的遗体，她要让真士在自己体内重新孕育，并且融合自己的力量，这样一来，真士就能获得永恒的生命，再也不会受伤，不会被杀死。
因为人类的身体很脆弱，无法一次性吸收全部灵力，所以澪决定分批给予，起初只需要赋予『吸收灵力的能力』就行了。
“真士”顺利出世了，一如普通人类母亲那般，澪生下了“真士”，但在“真士”懂事之后，澪删除了他的记忆，并暗中促使真士高中时期的同班同学、如今结为夫妇的五河夫妇收养了“真士”，“真士”随五河家姓氏，取名为『士道』。
为了让“真士”——士道如计划那样吸收灵力，澪将自身一部分力量分裂成十颗『灵结晶』，牺牲多条人命对其进行精炼，使得『灵结晶』能够被人体安全融合后，开始选择目标，人为制造精灵。
第一个被她赐予『灵结晶』转化成精灵的是名为“本条二亚”的女性，尔后是“时崎狂三”、“冰芽四糸乃”……一个又一个少女被澪随机选中转变成精灵，被删除了作为人类时的记忆，封入『邻界』沉眠。
期间也不是没有发生意外情况，比如二亚和狂三，一个使用『嗫告篇帙』调查自己，一个使用『刻刻帝』对自己发射【十之弹】，借助各自的『天使』，她们两个找回了自己的过往，也知道澪这个“幕后黑手”。
又比如在将其中一颗『灵结晶』，赐予给一个为了救小孩子被车撞死的少女时，这个名叫“风待八舞”的少女分裂成了两个人。
之所以会出现这种情况，是因为风待八舞原本应该作为双胞胎之一出生，但另一个双胞胎没能顺利发育，在子.宫孕育时被风待八舞吸收。
在风待八舞被澪赋予『灵结晶』重生时，因为体内有另一个双胞胎的因子，阴差阳错之下，『灵结晶』一分为二，风待八舞也因此分裂成八舞耶俱矢和八舞夕弦。
除此之外，在制造『灵结晶』的时候，澪直接以『灵结晶』创造了一个精灵（反转体），但因为是由纯粹的灵力所化成，这个精灵有强烈的攻击性，这让澪放弃了用『灵结晶』制造精灵的思路，换成让人类吸收『灵结晶』转变为精灵的方案。
澪念在对方是完全由灵力构成的纯粹精灵，如同她女儿般的存在，就没有粉碎重造，而是将其变回『灵结晶』保留下来，那个精灵的意识就一直沉睡在『灵结晶』中，不曾想在此期间，诞生了一个新的人格。
相比于原本的人格，新生的第二人格如同初生的婴儿，懵懂无知，于是澪解放了『灵结晶』，让这个第二人格主导的精灵自由行动，而这个精灵就是十香。
在澪陆陆续续制造精灵的时候，士道也在五河家一天天长大，他也越来越像曾经的真士，而且只要士道按照她计划的那样封印精灵、吸收灵力，隐藏在基因中那份属于真士的记忆，也会慢慢觉醒。
照这个趋势发展下去，士道最后就会变回真士吧？
澪原来是这样想的，但在暗中观察士道的成长过程中，她的想法渐渐变了，内心深处认识到一个事实——即使士道拥有真士的外貌和记忆，但……他们终究不是同一个人。
真士已经死了，如今的士道，只是以真士的基因重新孕育的生命，真士可以算是士道的“前身”，但却不能算是“前世”。
认清事实的澪，放弃了自欺欺人的愿望，但她没有放弃促使士道封印灵力的计划，因为……她需要创造一个能够杀死自己的存在。
只有和澪同根同源的灵力，才能够伤到她，因此，如果士道按照她计划的那样吸收了十颗『灵结晶』的灵力，就能获得和她相同的力量，能够对她造成伤害，将她杀死！
既然真士注定不会回来了，那澪也不想活了，她渴望死亡，盼望能在死后和真士重逢，只是她怎么也没有想到，计划出了差错，自己被囚禁，吸收灵力的人不是士道，而是一个叫“秦时然”的人。
从那个囚禁之地脱困后，与分身融合得知这一情况时，澪是想回收『灵结晶』，重新制定计划，让士道吸收，但是当秦时然展现出强大的实力后，澪改变主意了。
如果秦时然能够将她杀死，那就不需要重启计划，只要能让她如愿死亡，无论是谁都可以。
而且……让士道，她的【儿子】，毫不知情地平凡生活下去，或许会更好吧……
『对不起，因为我的一己之私，伤害了那么多人』
『谢谢你，让我能够迎来死亡，请允许我最后提一个请求，我的‘女儿’……十香她们拜托你了，请让她们一直幸福下去』
『士道……就让他维持现状吧，可以的话，请让他和真那相认，但不要告诉他们真相』
『小士（真士）…我好想你…还能…再见到你吗……』
……
“……这就是一切的经过了。”
樱花庄公寓201室的房间里，精灵们围坐在一起，听完秦时然的讲述后，纷纷陷入沉默，久久不知作何发言。
在崇宫澪被【炼狱魅影】消灭后，秦时然不仅顺利接收了她的力量，还意外收获了一些记忆碎片，这些记忆碎片拼凑出了一份真相，崇宫澪一直以来的所作所为，都有了答案。
崇宫澪的一生是不幸的。
作为复仇的工具而诞生；
给心爱的人招来杀身之祸；
几乎全知全能，却挽不回逝去的生命，连死亡都成了遥不可及的奢望；
为了寻死，利用、欺骗、伤害、牺牲了太多太多人……
可恨之人，必有可怜之处，崇宫澪犯下的罪孽无法洗清，她的过往也让人同情，一切的一切，都随着她的消逝，画上一个不算圆满的句号。
良久，琴里假咳一声，打破沉默的气氛，语气复杂道：“没想到，令音…崇宫澪会是士道的亲生母亲，这件事…还是瞒着他吧。”
有时候，知道得越多未必是好事，一想到其中牵扯甚多，琴里决定还是对自家义兄隐瞒崇宫澪的事情，而且三言两语也说不清，还是让五河士道继续普普通通的过日子吧。
“呵……到头来，居然是因为这种理由，那个女人……”
狂三嘴角勾起冷笑，眼中却流露出一丝惆怅，得知崇宫澪的过往，虽然还是恨她，但恨意多少冲淡了些许。
耶俱矢挠了挠头，苦笑道：“说实话，本宫其实有点感激那个人，按时然所言，若不是她将吾等前身之八舞变为精灵，本宫和夕弦也无法像现在这样面对面。”
“同意。夕弦的想法和耶俱矢完全一致。”
夕弦面无表情地说道，然后与耶俱矢默默对视，感慨万分，假如风待八舞没有被崇宫澪赐予『灵结晶』，那就死于见义勇为了，而她们也不可能诞生。
事实上，崇宫澪对于一部分精灵来说，算是恩人，除了八舞姐妹，狂三也是在遭遇事故时被崇宫澪救下，美九是在忍受不了失声症和网暴自寻短见时被崇宫澪赋予“新生”。
除此之外，还有四糸乃和七罪，自从得知精灵可能曾经都是人类后，琴里就通过『拉塔托斯克』的情报力量调查过往三十年的失踪少女，费了一番功夫，还真的查到了。
四糸乃还是人类时，全名为“冰芽四糸乃”，因为身患重病需要长期住院，家人就只有母亲，一个很乐观的女人，虽然为了医疗费辛苦工作，但在女儿面前从未表现出消极情绪，一直积极鼓励四糸乃。
然而天有不测风云，四糸乃的母亲出了意外，不幸去世，就在当天，四糸乃突然病情加重，生命垂危，然后就失踪了。
可以推测出，当时是崇宫澪将四糸乃转化为精灵，让她得以脱离病危，但也失去了和母亲的记忆。
七罪的过往则是不堪回首，她的全名叫“镜野七罪”，母亲是别人的情.fu，也就说，七罪是个私生女。
在母亲被抛弃后，七罪就遭到了母亲的虐待，经常被打，还挨饿，惨到需要去喝公园水龙头的水，营养不良导致她瘦得跟豆丁似的，被不少人嘲笑过，这也是她自卑的原因，这份自卑感，即使记忆被删除，也依然保留下来了。